Fofonov a été contrôlé positif à l'heptaminol à l'issue de la 18e étape", a dit à Reuters le président de l'AFLD, Pierre Bordry.
Fofonov avait terminé le Tour à la 19e place au général.
L'heptaminol est un vasodilatateur qui permet d'augmenter le débit aortique.
Le Kazakh est la quatrième victime de l'AFLD sur ce Tour de France après les Espagnols Manuel Beltran et Moises Duenas et l'Italien Riccardo Ricco, contrôlés positifs à l'EPO.
Âgé de 31 ans, il avait commencé sa carrière dans la petite équipe belge Collstrop en 1999.
Fofonov avait ensuite couru chez Besson Chaussures en 2000, chez Cofidis entre 2001 et 2005 avant d'être recruté par le Crédit Agricole.
Il avait remporté la dernière étape du Critérium du Dauphiné-Libéré à la fin du mois de juin à Grenoble.
Coureur discret, résidant en Auvergne, il ne s'était pas montré particulièrement offensif durant ce mois de juillet, faisant preuve de régularité en montagne pour terminer dans les 20 premiers du Tour pour la première fois.
Ce contrôle positif intervient alors que le manager du Crédit Agricole Roger Legeay est à la recherche d'un repreneur pour son équipe la saison prochaine.